2000年， 学校成为全区师范布局调整后唯一保留的师范学校后，在发展中注重中师教育民族特色的同时，根据高等师范教育的目标和要求，逐步探索总结专科层次的办学体制、课程设置、教学方法、教学管理的规律，为西藏自治区师范教育三级师范向两级师范过渡积累了丰富的经验，该校还具有多年从事高等学历师资培训的实践经 验。1998年在全自治区开办第一个小教大专班。1999年起，举办三、二分段小教大专班，并与南京师范大学、首都师范大学和西藏大学联合创办大专层次的函授教育。办班7年来，积累了培养大专层次小教师资的丰富经验。学校从2000年面向全区招生，开始承担全区小学、幼儿教师和教育行政管理干部及中小学校长的培养、培训任务。2003年，停止招收中师学生。2006年2月14日，经国家高校设置委员会批准，学校升格为拉萨师范高等专科学校。